Description : |
Les arbres phylogénétiques sont un outil fondamental pour comprendre et étudier l'évolution mais leur reconstruction à partir de séquences moléculaires est un problème d'inférence statistique difficile. Il est nécessaire d'évacuer les biais potentiels d'inférence avant de reconstruire l'arbre, puis d'étudier sa stabilité avant d'en tirer des conclusions biologiques.
Dans un premier temps, on introduira la reconstruction d'arbres à partir d'un alignement de séquences d'ADN et mettant en avant deux sources possibles d'erreurs: la présence dans l'alignement de gènes non congruents et celle de données aberrantes. On présentera ensuite une méthode, basée sur des développements de Edgeworth, pour détecter la non congruence d'un gène avec le reste de l'alignement puis une méthode, basée sur les fonctions d'influence, pour identifier les données aberrantes. On les appliquera enfin sur des alignements réels avant de discuter des résultats. |
Equipe organisatrice : |
Probabilités et Statistiques |
Jury (Thèse / HDR) : |
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Orateur : |
Mahendra Mariadassou
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Titre (Thèse / HDR) : |
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Université Orateur : |
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URL Orateur : |
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Ressource : |
Laboratoire J.A.Dieudonné - Salle de conférence |
Date de début : |
11:30 - jeudi 05 novembre 2009 |
Durée : |
1 heure(s) |
Date de fin : |
12:30 - jeudi 05 novembre 2009 |
Type : |
Séminaire |
Réservation effectuée par : |
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Dernière mise à jour : |
17:20 - jeudi 07 février 2013 |