Contact
Laboratoire Jean-Alexandre DIEUDONNEUniversité Côte d'Azur,
Faculté des Sciences - Parc Valrose
06108 Nice Cedex 2
+33 4 89 15 04 78
Batiment Fizeau, bureau 15-02
claire.guerrier@univ-cotedazur.fr
Claire Guerrier
Chercheur invitée, Université McGill, Département de Physiologie et Médecine - CRM Chargée de recherche CNRS, Université Côte d'Azur Docteure en Mathématiques Appliquées et Biologie Computationelle.
Mon travail consiste à étudier les structures neuronales à différentes échelles, allant des synapses aux réseaux neuronaux. Mon objectif est de développer et d'analyser des modèles mathématiques, afin de déterminer comment les propriétés des neurones au niveau moléculaire façonnent leur activité, et se propagent au niveau du réseau. Ce changement d’échelle peut être formulé et analysé à l’aide de plusieurs outils tels que les équations aux dérivées partielles, les processus stochastiques ou les simulations numériques.
- Chercheur invitée, Université McGill, Département de Physiologie et Médecine - CRM
- 2021 - 2022 , accueillie par le Pr. Anmar Khadra.
- Chargée de recherche CNRS, Université Côte d'Azur, Laboratoire J.A. Dieudonné.
- 2019 - .
- Chercheur invitée, Université McGill, Départment de physiologie et médecine.
- nov 2019 - nov 2020, accueillie par le Pr. Anmar Khadra.
- Stage postdoctoral à l'Université de Colombie-Britannique (Canada).
- 2016 - 2018, sous la direction de Dan Coombs et Kurt Haas, dans le département de mathématiques et au Brain Research Center (UBC). Comment l'expérience modifie le codage neuronal. Modélisation de la dynamique du calcium dans les neurones du têtard Xenopus en réponse à des stimuli visuels, pour étudier leur impact sur la croissance et la morphologie des neurones. L'objectif est de comprendre comment les neurones traitent l'information, et modifient leur codage en fonction de leur expérience.
- Thèse de doctorat à l'École Normale Supérieure et à l'Université Paris VI.
- 2011 - 2015, sous la direction de David Holcman., dans le groupe Applied Mathematics and Computational Biology. Sujet : Modélisation multi-échelle et analyse asymptotique pour les synapses et les réseaux de neurones. Développement et analyse de modèles mathématiques, afin de déterminer comment les propriétés des synapses au niveau moléculaire façonnent leur activité et se propagent au niveau du réseau. Les principaux outils que j'utilise sont les équations aux dérivées partielles, les processus stochastiques et les simulations numériques .
- Paul Paragot, thèse en co-supervision avec Stella Krell, Université Côte d'Azur, Nice, France.
- Oct 2020 -- Projet: Numerical analysis, Modeling and Data analysis: characterizing and localizing calcium sources in the neuronal dendritic tree, to understand the foundations of cognitive development.
- Supervision stage de M2, Université Côte d'Azur, Nice
- Mar-Aug 2021 Projet: Multi-scale model of axon-oligodendrocytes interactions: how axonal activity regulates myelin plasticity.
- Supervision stage de M2, avec Stella Krell, Université Côte d'Azur, Nice
- Avril-Oct 2020 Projet: Numerical analysis of the Poisson-Nernst Planck system of equations to study the propagation of a transient signal in neurons.
- Supervision d'étudiant de premiere annee, Grad school QLS program, McGill University, Montreal.
- Sept-Dec 2019 Projet: Modeling axon-myelin relationships.
- Supervision d'un étudiant en stage d'été, Université McGill, Montreal.
- Juil-Aout 2019 Projet: Modeling axon-myelin relationships.
- Supervision d'un étudiant en stage d'été, UBC, Vancouver.
- Juillet - Aout 2018 Projet: Modeling Syphilis incidence in MSM population in Vancouver.
- Bourse de la Fondation Fyssen
- Bourse postdoctorale de 2 ans.
- Bourse de la Fondation pour la Recherche Médicale
- Financement “Fin de thèse” de 12 mois pour l’annee 2015.
- Bourse du Labex MemoLife
- IBENS Financement de thèse de 4 mois, de septembre a décembre 2014.
- Lauréate de la Bourse Elsevier-AFFDU 2014.
- Dynamics Days Europe conference 2021, Nice
- 23-27 Août 2021.
- Mathematical Biology Session at the CMS Winter Meeting 2020, Montréal
- 3-8 Décembre 2020.
- Workshop "Non linear dynamics in Neuroscience", Nice
- 4 Mars 2020. Evenement ModeLife. Le programme est disponible ici.
- Master 2 à l'Université Paris VI.
- 2010-2011, Master de Science et Technologies, mention Mathématiques et Applications, Spécialité Mathématiques de la Modélisation. Mention Bien.
- Agrégation Externe de Mathématiques.
- Juillet 2010, Option probabilités et statistiques.
- Normalienne ENS-Cachan-Antenne de Bretagne.
- 2009-2011.
- Guerrier C, Dellazizzo Toth T, Galtier N and Haas K., " An algorithm based on a Cable-Nernst Planck model predicting synaptic activity throughout the dendritic arbor with micron specificity." Neuroinform (2022)
- Galtier N and Guerrier C, "Sinaps: A Python library to simulate voltage dynamic and ionic electrodiffusion in neurons"
- Guerrier C and Holcman D, " The first 100 nm inside the pre-synaptic terminal where calcium diffusion triggers vesicular release." Front. Synaptic Neurosci. 10:23 (2018)
- Sakaki K, Coleman P, Dellazizzo Toth T, Guerrier C and Haas K," Automating Event-detection of Brain Neuron Synaptic Activity and Action Potential Firing in vivo using a Random-access Multiphoton Laser Scanning Microscope for Real-time Analysis." 40th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (2018)
- Guerrier C and Holcman D," Multiscale models and stochastic simulation methods for computing rare but key binding events in cell biology" J. Comp. Phys. 340 pp.617-638 (2017)
- Basnayake KC, Guerrier C, Schuss Z and Holcman D, " Asymptotics of extreme statistics of escape time in 1,2 and 3-dimensional diffusions. " arXiv:1711.01330
- Guerrier C and Holcman D, " Hybrid Markov-mass action law model for cell activation by rare binding events: Application to calcium induced vesicular release at neuronal synapses. " Scientific Reports 6:35506 (2016) Un résumé du projet est disponible ici, sur le site bionewmetrics.org.
- Guerrier C, " Multi-scale modeling and asymptotic analysis for neuronal synapses and networks. " Thèse de doctorat (2015)
- Guerrier C and Holcman D, "Search time for a small ribbon and application to vesicular release at neuronal synapses" SIAM MMS 13(4) pp. 1173-1193 (2015)
- Guerrier C, Hayes JA, Fortin G and Holcman D, " Robust network oscillations during mammalian respiratory rhythm generation driven by synaptic dynamics." Proc. Natl. Acad. Sci. 112(31) pp.9728-33 (2015) Un résumé du projet est disponible ici, sur le site bionewmetrics.org.
- Guerrier C and Holcman D, "Brownian search for targets hidden in cusp-like pockets: Progress and Applications" European Physical Journal ST 223 pp.3273-3285 (2014)
- Guerrier C, Korkotian E and Holcman D, "Calcium dynamics in neuronal microdomains: modeling, stochastic simulations and data analysis" In Jaeger D. jung R (eds.) Encyclopedia of Computational neuroscience pp.1-37 Springer New York Heidelberg Dordrecht London (2014).
- Séminaire de Mathématiques appliquées, CNRS IRL , UQAM, Montréal, Canada Juin 2022 Talk: Signal propagation in myelinated axons: relating structure to function using mathematical modeling and simulations.
- Mathematical modeling and statistical analysis in neuroscience , Institut Henryi Poincaré, Paris, France Fev 2022 Talk: Multi-scale modeling of vesicular release at neuronal synapses.
- McGill Physiology seminar , Université McGill, Montréal, Canada Dec 2020 Talk: Signal propagation in myelinated axons: relating structure to function using mathematical modeling and simulations.
- CAMBAM zoominar , Université McGill, Montréal, Canada Mai 2020 Talk: Modeling axon-myelin relationships: insights on signal propagation and modulation
- KIM MUSE Data and Life Sciences, Université Montpellier 2, France Fev 2020 Talk: Asymptotic analysis of the narrow escape problem at a cusp. Application to multi-scale modeling of vesicular release.
- Workshop Dreams, Université Cote d'Azur, Nice, France Dec 2019 Talk: Emergence of spontaneous rhythmic patterns in the pre-Bötzinger Complex.
- Mini-course Institut NeuroMod, Université Cote d'Azur, Nice, France Dec 2019 Presentation of several tools to address multi-scale modeling in neuroscience
- Workshop ``Advanced asymptotics of PDEs and applications'', CRM Pisa, Italie Septembre 2018 Talk: Asymptotic analysis and multi-scale modeling of vesicular release at neuronal synapses.
- Séminaire Math-Bio , University of British Columbia Vancouver, Canada Mars 2018 Talk: Modeling calcium dendritic activity in Xenopus tadpole neurons.
- Séminaire Math-Bio , University of British Columbia Vancouver, Canada Janvier 2017 Talk: Multi-scale modelling of vesicular release at neuronal synapses.
- Facultad de Ciencas Exactas y Naturales , Universidad Nacional de CUYO, Mendoza, Argentina Octobre 2016. Talk: Multi-scale modeling and simulations to compute the time distribution of vesicular release at neuronal synapses.
- Séminaire du Laboratoire J.A. Dieudonné, Mathematiques et interactions , Université Nice-Sopha Antipolis, Nice, France Mai 2016. Talk: Mathematical modeling and multiscale simulations for vesicular release at neuronal synapses.
- Conférence "Les probabilités de demain", Institut des Hautes Études Scientifiques, Bures-sur-Yvette, France Mai 2016. Talk: Asymptotic analysis for vesicular release at neuronal synapses
- International Workshop on Brownian Motion in Confined Geometries, Max-Planck Institute für Physik Komplexer Systeme, Dresden. Mars 2014. Poster : Diffusion in the confined pre-synaptic terminal.
- International Workshop on Cell Membranes, Institut Curie, Paris. Mars 2014. Poster : Emergence of spontaneous rythmic patterns in the pre-Bötzinger Complex.
- Séminaire Interne de l'IBENS, École Normale Supérieure, Paris. Mai 2012. Poster : Emergence of spontaneous rhythmic patterns in neural networks.
- Cours dans le MSc Modeling for Neuronal and Cognitive System, Institut NeuroMod, Université Côte d'Azur
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since 2020
- Mathematical Modeling at the molecular and cellular level
- Chargée de cours, UBC, Vancouver
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Mai-Juin 2018
- Algèbre linéaire appliquée, 3ème année.
- Supervision d'un étudiant en stage d'été, UBC, Vancouver.
- Mai - Aout 2017 Projet: Writing using the NEURON software a code for calcium dynamic in the dendritic tree.
- Open Science Network, Vancouver, Science, Technology, Engineering and Mathematics Mentoring Event (STEM)
- Nov 2017 Connecting high school students with STEM professionals.
- Chargée de cours, Ecole Normale Supérieure, Paris
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Sept - Dec 2015
- Mathematical methods for modeling and analysis of neuronal networks, synaptic transmission and single photon response, 5ème année. En collaboration avec J. Reingruber.
- Monitorat dans le cadre de la thèse à l'Université Paris VI.
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2011-2014
- Méthodes numériques pour les EDO, L3. Colles.
- Suites et Intégrales, L1. TD Classique et TD "Sportifs de haut niveau".
- Colles en BCPST et PT*
- 2010-2012, Lycée Chaptal, Paris.
- Tutorat de Mathématiques.
- 2009-2010, IUT d'Informatique d'Orsay.